明萬歷十一年（1583年）復置長武縣增編八里，進賢里轄區(qū)內就有南村村名。

明清多次變更，南村都屬進賢里管轄。

到民國年間實行保甲制，南村屬北區(qū)第三保管轄。

全國解放后設縣區(qū)鄉(xiāng)村四級行政單位，南村屬第二區(qū)第三鄉(xiāng)（即鎮(zhèn)南鄉(xiāng)）管轄。

1958年人民公社化后，南村屬相公人民公社三興大隊生產隊。

1961年分縣分隊后重建南村大隊，屬相公公社管轄。

1984年政社分設，成立南村村民委員會，歸相公鄉(xiāng)人民政府管轄。

1998年，撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，歸相公鎮(zhèn)人民政府管轄。

2007年，邱渠村并入南村，保留南村村民委員會，歸相公鎮(zhèn)人民政府管轄至今。