縣域春秋戰(zhàn)國(guó)時(shí)屬齊國(guó)祝阿地，西漢隸平原郡祝阿縣。

東漢，耿濟(jì)鎮(zhèn)正式成為政區(qū)名稱(chēng)，隸平原郡祝阿縣。

三國(guó)至隋，仍祝阿地。

唐天寶元年（742）廢祝阿為禹城，耿濟(jì)鎮(zhèn)屬禹城縣，隸齊州濟(jì)南郡。

宋，始改耿濟(jì)鎮(zhèn)為濟(jì)河鎮(zhèn)，繼稱(chēng)齊河鎮(zhèn)，隸齊州濟(jì)南府禹城縣。

金天會(huì)八年（1130），升鎮(zhèn)為縣，正式成為縣級(jí)政區(qū)。

元，隸德州；明、清隸濟(jì)南府。

1912年起，先隸濟(jì)南府，后直屬山東省。

抗日戰(zhàn)爭(zhēng)全面爆發(fā)后，縣境分北、中、南部共3個(gè)縣級(jí)人民政權(quán)行政，北部先后稱(chēng)齊河縣、齊濟(jì)縣、齊臨縣，初隸冀魯邊二專(zhuān)區(qū)，1944年隸渤海區(qū)濼北專(zhuān)區(qū)；中部先后稱(chēng)齊河縣、齊禹縣，1942年隸冀魯豫區(qū)一專(zhuān)區(qū)，1949年隸濼北專(zhuān)區(qū)；南部先后稱(chēng)長(zhǎng)清縣、河西縣、長(zhǎng)清縣、河西縣，1942年隸冀魯豫一專(zhuān)區(qū)，1949年隸濼北專(zhuān)區(qū)。

1950年5月，北、中部合并，稱(chēng)齊河縣，隸德州專(zhuān)區(qū)。

1956年5月南部原河西縣部分劃入，隸聊城專(zhuān)區(qū)。

1961年復(fù)隸德州專(zhuān)區(qū)，1980年改稱(chēng)德州地區(qū)。

1990年縣東部三鄉(xiāng)鎮(zhèn)劃入濟(jì)南市，成今境域，屬德州地區(qū)。

1994年12月德州地區(qū)改稱(chēng)德州市，歸屬德州市管轄至今。